Lo scorso anno l'Interporto di Bologna ha registrato un traffico merci complessivo di 4.510.000 tonnellate (di cui 2.210.000 tonnellate di traffico intermodale), con un aumento del 3% rispetto al 2004. Il traffico ferroviario da e per l'interporto è stato di 5.985 treni, contro 5.668 treni nell'esercizio 2004. L'aumento del numero dei treni ha conseguentemente portato un incremento delle manovre che, nel 2005, hanno registrato 43.212 carri movimentati rispetto ai 41.806 del 2004, con un incremento del 3,4%.
Interporto di Bologna Spa ha archiviato l'esercizio 2005 con un utile netto di 200.427 euro, un margine operativo lordo di 1.372.097 euro e un valore delle vendite e delle prestazioni di 11.363.523 euro.