Nel secondo trimestre dell'anno fiscale 2006, conclusosi lo scorso 31 marzo, il tonnellaggio delle navi transitate nel canale di Panama è stato pari a 75,0 milioni di tonnellate PC/UMS (Panama Canal/Universal Measurement System), con una crescita del 5,7% rispetto a 70,9 milioni di tonnellate PC/UMS totalizzate nel corrispondente periodo dell'anno fiscale precedente.
Nel primo trimestre di quest'anno il canale è stato attraversato da 3.862 navi, con un incremento del 3,5% rispetto a 3.730 unità nei primi tre mesi del 2005. Il transito di navi di gabarit Panamax è stato di 1.501 unità, con un aumento del 7,5% rispetto a 1.396 navi Panamax nel primo trimestre dello scorso anno.
Nei primi tre mesi del 2006 il tasso di incidenti è diminuito del 3,4% attestandosi a 1,04 incidenti ogni 1.000 transiti.
Il Canal Waters Time (CWT), il tempo medio necessario ad una nave per attraversare il canale (incluso il tempo di attesa per il transito), è ammontato a 30,08 ore, con un aumento del 15,8% rispetto a 25,98 ore nel primo trimestre dello scorso anno. Il CWT per le navi che avevano prenotato il transito è aumentato del 3,4% a 16,85 ore. L'utilizzo del sistema di prenotazione dei transiti, con un totale di 2.006 prenotazioni, è aumentato dell'11,6%.